Le jardin botanique du musée Balaguier a été créé en 2008 autour du voyage des plantes et du jardin botanique de la marine de Toulon.
Ce jardin offrant une vue panoramique sur la mer, se compose de dix petits espaces thématiques qui évoquent le voyage des plantes et leur acclimatation dans la rade de Toulon :
• Le jardin des senteurs où règnent en maîtres incontestés les plantes aromatiques : sauge, romarin, lavande...
• Le jardin des voyages avec des plantes d'Australie : eucalyptus, acanthe...
• Le jardin des graminés : carex, miscanthus
• Le jardin des cactées et plantes grasses
• Le jardin asiatique : bambous noirs, jacinthes d'eau
• Le jardin exotique : fougères, oiseaux du paradis, cycas...
• Le jardin des plantes industrielles et tinctoriales : lin, indigo
• Le jardin des agrumes : mandariniers, citronniers, bigaradiers...
• Le jardin des simples constitué de plantes médicinales : verveine, géranium, camomille...
• Le potager : tomates anciennes, topinambours...
• Le jardin des senteurs où règnent en maîtres incontestés les plantes aromatiques : sauge, romarin, lavande...
• Le jardin des voyages avec des plantes d'Australie : eucalyptus, acanthe...
• Le jardin des graminés : carex, miscanthus
• Le jardin des cactées et plantes grasses
• Le jardin asiatique : bambous noirs, jacinthes d'eau
• Le jardin exotique : fougères, oiseaux du paradis, cycas...
• Le jardin des plantes industrielles et tinctoriales : lin, indigo
• Le jardin des agrumes : mandariniers, citronniers, bigaradiers...
• Le jardin des simples constitué de plantes médicinales : verveine, géranium, camomille...
• Le potager : tomates anciennes, topinambours...







